Sus más recientes novelas son El espíritu de la luz (San Juan: Editorial, Universidad de Puerto Rico, 2010) y La piscina (Buenos Aires: Corregidor, 2012). Además, ha publicado los siguientes libros de crónicas y ensayos: Las tribulaciones de Jonás, 1981; El entierro de Cortijo, 1983; Una noche con Iris Chacón, 1986; Campeche o los diablejos de la melancolía, 1986; Puertorriqueños, 1988; El cruce de la Bahía de Guánica, 1989; Cámara secreta, 1994; Peloteros, 1997; Elogio de la fonda, 2000; Caribeños, 2002; Mapa de una pasión literaria, 2003; Musarañas de domingo, 2004; y San Juan, Ciudad Soñada, 2005. En 2009 publica con Beatriz Viterbo de Argentina su Antología Personal de crónicas titulada La nave del olvido. Acaba de publicar, con la editorial Callejón, el libro de ensayos Mapa desfigurado de la Literatura Antillana (2012).

En 1986 recibió una Beca Guggenheim de Literatura. Años más tarde, en 1992, fue primer finalista del Premio Planeta-Joaquín Mortiz con su novela Cartagena, y dos años después fue primer finalista del Concurso Internacional de Novela “Francisco Herrera Luque” con El camino de Yyaloide, editada por Grijalbo en 1994. En 1995 ganó dicho concurso con Sol de medianoche, novela también galardonada con el Premio Bolívar Pagán del Instituto de Literatura de Puerto Rico en 2001.

El entierro de Cortijo fue traducido al inglés en 2004 por Duke University Press con el título Cortijo’s Wake, y en 1991 al francés por Éditions L’Harmattan con el título L’enterrement de Cortijo. En 1997 la editorial Four Walls Eight Windows de Nueva York publicó la traducción al inglés de La renuncia del héroe Baltasar (The Renunciation), a cargo de Andrew Hurley. Bajo el título San Juan, Memoir of a City, en 2007 The University of Wisconsin Press publicó la traducción al inglés de su guía literaria de San Juan titulada San Juan, Ciudad Soñada. La traducción estuvo a cargo de Peter Grandbois y el prólogo de la primera edición en castellano fue escrito por Antonio Skármeta. Su novela Mujer con sombrero panamá, editada en España por Mondadori en 2004, fue premiada por el Instituto de Literatura Puertorriqueña como la mejor novela del año.

Desde 1999 Edgardo Rodríguez Juliá es miembro de número de la Academia Puertorriqueña de la Lengua Española, adscrita a la Real Academia Española, y en el 2006 fue nombrado Profesor Distinguido en el Conservatorio de Música de Puerto Rico. Es Escritor Residente de la Universidad del Turabo desde 2007. También ha dictado cátedra, como Profesor Visitante, en la Florida International University. En esta universidad ha tenido a su cargo cursos de Composición Literaria y un curso graduado sobre Literatura Antillana. Hasta junio de 2010 dirigió la colección Antología Personal en La Editorial, Universidad de Puerto Rico, así como la revista La Torre de la misma institución.

En junio de 2011, impartió en la Universidad de Guadalajara la prestigiosa cátedra Julio Cortázar, cátedra presidida por los escritores Carlos Fuentes y Gabriel García Márquez. Y hacia fines de abril 2012 dictó la Conferencia Raimundo Lira en la Universidad de Harvard.

Se le dedicó la edición 2012 del Festival de la Palabra en San Juan; en esta ocasión dictó una de las conferencias magistrales.